物流公司自己支付購買運費。
借:庫存商品等。
貸款:銀行存款
預付運費，付款。
借:預收賬款-運費
貸款:銀行存款
支付運費對應的進項稅額是否可以抵扣；
銷售貨物時，支付運費:如果銷售的貨物是免稅的增值稅項目，計稅方法簡單等不能產生銷項稅的，即使取得增值稅專用發票，支付的運費也不能抵扣進項稅；
購買貨物時，支付運費:如果購買的貨物用於免征增值稅的物品、集體福利或個人消費等。，且不能生成銷項稅，即使取得增值稅專用發票，支付的運費也不能從進項稅中抵扣；
購進貨物用於增值稅應稅項目並取得普通發票，但支付的運費有增值稅專用發票的，可以憑票抵扣運費進項稅額；未取得增值稅專用發票的，不得抵扣運費進項稅額。