註冊會計師與治理層溝通的事項包括：（1）註冊會計師與財務報表審計相關的責任；（2）計劃的審計範圍和時間安排；（3）審計中發現的重大問題；（4）值得關註的內部控制缺陷；（5）註冊會計師的獨立性；（6）補充事項。選項C和選項D屬於審計中發現的重大問題。