審計的主要方法有核對法、審閱法、復算法、比較法、分析法、逆查法等。
1、核對法
核對法是將會計記錄及其相關資料中兩處以上的同壹數值或相關數據相互對照，用以驗明內容是否壹致，計算是否正確的審計方法，其目的是查明證、賬、表之間是否相符，證實被審單位財務狀況和財務成果的真實、正確、合法。
2、審閱法
審閱法是對憑證、帳簿和報表，以及經營決策、計劃、預算、合同等文件和資料的內容詳細閱讀和審查，以檢查經濟業務是否合法規，經濟資料是否真實正確，是否符合會計準則的要求。審閱法主要是查證證、帳、表等會計資料。
3、復算法
復算法就是對憑證、帳簿和報表以及預算、計劃、分析等書面資料重新復核、驗算的壹種方法。這種方法是包含在核對法之中的。
復核驗算的主要方面有：壹是原始憑證中單價乘數量的積數，小計、合計等，二是記帳憑證中的明細金額合計，三是帳簿中每頁各欄金額的小計、合計、余額，四是報表中有關項目的小計、合計、總計及其它計算，五是預算、計劃、分析中的有關數據。
4、比較法
比較法就是通過相同被審項目的的實際與計劃、本期與前期、本企業與同類企業的數額進行對比分析，檢查有無異常情況和可疑問題，以便跟蹤追查提供線索，取得審計證據。
如以本期的有關項目相比（如利潤未同產品銷售收入同步增長），以被審項目同其它單位的相同項目相比（如把流動資金周轉水平同先進企業比），都可以說明情況，發現問題。
5、分析法
分析法就是通過分解被審項目的內容，以揭示其本質和了解其構成要素的相互關系。
6、逆查法
就是按照經濟活動進行的相反順序，從終點查到起點的審計方法。在財務收支審計中，它就是按照會計核算程序的相反次序，先審查會計報表，從中發現錯弊和問題，然後有針對性地依次審查和分析報表、帳簿和憑證。