商學院，前身為南通工學院經濟貿易系，創建於1994。2004年，在三校合並改革的實踐中，在原南通工學院經濟貿易系的基礎上成立了商學院。學院自成立以來，在原有專業的基礎上不斷拓展新的專業。設有國際經濟與貿易、會計、工商管理、人力資源管理、市場營銷、電子商務、物流管理等7個本科專業，擁有經濟管理類學士學位授予權。
學院現設有國際經濟與貿易、會計、工商管理、人力資源管理四個教研室，1實驗中心，1資料室，1沿海經濟研究所。實驗中心由金蝶ERP實驗室、金融工程實驗室和建設中的電子商務實驗室組成。資料室有2900多本書和300多種期刊。
現有教職工81人，專任教師65人，其中教授4人，副教授8人，專任教師高職比例為18.5%。博士6人，碩士46人，具有碩士、博士學位的教師占專任教師總數的80%。還有6名專業教師正在攻讀博士學位(其中3人年內可獲博士學位)，師資隊伍發展呈現良好態勢。專任教師中，江蘇省有突出貢獻中青年專家1人，江蘇省“333人才培養工程”二級培養對象1人，甘肅省“555人才培養工程”二級培養對象1人，江蘇省“藍色工程”優秀青年骨幹教師2人，南通市拔尖人才65438+人。