政府會計權責發生制和收付實現制的區別如下：
1、定義不同。權責發生制它是以本會計期間發生的費用和收入是否應計入本期損益為標準，處理有關經濟業務的壹種制度。收付實現制亦稱收付實現基礎。是權責發生制的對稱。在會計核算中，是以款項是否已經收到或付出作為計算標準，確定本期收益和費用的方法。
2、會計核算的標準不同。權責發生制是以取得收款權利付款責任作為記錄收入或費用的依據。凡在本期發生應從本期收入中獲得補償的費用，均應作為本期的費用處理，收入也是如此。收付實現制是根據貨幣收支是否來作為收入確認和費用確認和記錄的依據。
3、使用範圍不同。權責發生制壹般用於企業經營情況。按照《企業會計準則》《金融保險企業財務制度》規定，企業進行會計核算應以權責發生制為基礎，遵循權責發生制原則。收付實現制主要用於銀行應收未收息的工作。
權責發生制的優點和缺點：
權責發生制優點是可以正確反映各個會計期間所實現的收入和為實現收入所應負擔的費用，從而可以把各期的收入與其相關的費用、成本相配合，加以比較，正確確定各期的收益。權責發生制，能夠恰當地反映具體某壹會計期間的經營成果。
權責發生制會計把經濟活動有關的成本和利潤記錄，同現金的實際收支區分開來。在權責發生制中，利潤是主要的階段性業績指標。經濟交易的結果按預期的而不是實際的現金收支進行記錄。權責發生制在反映企業的經營業績時有其合理性，幾乎完全取代了收付實現制。
但在反映企業的財務狀況時卻有其局限性：在損益表上看來經營很好，效率很高的企業，在資產負債表上卻可能沒有相應的變現資金而陷入財務困境。為提示這種情況，應編制以收付實現制為基礎的現金流量或財務狀況變動表。彌補權責發生制的不足。