1、工作的性質不同
跨境電商專業主要是壹些事務性的工作。人事部門負責招待領導的決策。
而電子商務專業則包含戰略性的工作和事務性的工作，批準作用的組織、領導會計機構或會計人員依法進行會計核算，實行會計監督。
2、職責不同
跨境電商專業負責本單位財產物資的統壹管理，每年進行壹次財產清查，健全保管、領用、維護、賠償、報廢、報損以及人員調動交接制度，保證賬物相符。
而電子商務專業負責組織編制本單位資金的籌集計劃和使用計劃，並組織實施。資金的籌集計劃和使用計劃要結合本單位的經營預測和經營決策以及生產、經營、供應、銷售、勞動、技術措施等計劃，按年、按季、按月進行編制，
並根據企業的經濟核算責任制將各項計劃指標分解下達落實，督促執行。根據生產經營發展和節約資金的要求，組織有關人員，合理核定資金定額，加強資金的使用管理，提高資金使用效果。根據管用結合和資金歸口分級管理的要求，擬定資金管理與核算實施辦法，並組織有關部門貫徹執行
3、考核內容不同
跨境電商專業主要考核能否認真貫徹執行國家的憲法、法律、法令，是否具備工作人員應有的道德品質、是否具有做好本職工作的業務技能，以及必備的文化知識和實際工作能力。
而電子商務專業主要考核，出勤情況、學習成績和工作態度，完成任務的數量、質量、效率等。
4、工作內容不同
跨境電商專業主要制定、修改關於權限和職能責任的組織結構，建立雙軌的、相互的、縱向及橫向的信息交流系統。預測對於工作人員的需求，做出人員投入計劃，並對所需要的管理政策和計劃做出預先設想。
人員的配備和使用：即按照工作需要，對工作人員進行錄用、調配、考核、獎懲、安置等。幫助工作人員不斷提高個人工作能力，進行任職前培訓和在職培訓。
而電子商務專業主要根據按勞分配的原則，做好工作人員的工資定級、升級和各種保險福利工作。通過各種教育方式，提高工作人員的思想政治覺悟，激勵工作人員的積極性、創造性。對工作情況和程序進行總結、評價，以便改進管理工作。
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