審計局與會計事務所的區別主要有：
性質不壹樣：審計局是政府部門，會計師事務所是企業。會計師事務所是指依法獨立承擔註冊會計師業務的中介服務機構，審計局是地方各級審計局均為行政單位，國家公務員編制。
服務對象及作用不壹樣：審計局主要負責地方政府各部門和所有企事業單位的審計監督工作。會計事務所是連接政府和企業的橋梁，所有者和經營者之間的紐帶，獨立於政府和企業之外、不以盈利為首要目標、具有法定社會職能的第三人。
目的不壹樣：會計事務所裏註冊會計師是對財務報告出具審計意見，而審計局主要是對資金及資產的使用是否違規進行審查。
審計局主要負責地方政府各部門和所有企事業單位的審計監督工作。審計局壹般設有辦公室、財政金融審計科、行政事業審計科、經貿審計科、固定資產投資審計科、農業資源與環境審計科、幹審科、幹部經濟責任審計辦公室、內審協會等科室。組織實施國家、省審計方針政策、法律法規；受委托研究起草有關審計行政管理的地方性法規、規章草案，經審議通過後組織實施指導、協調監督各級審計機關的業務。向市人民政府報告和向市人民政府的有關部門通報審計情況，提出制定和完善有關政策法規的建議。
會計師事務所是依法設立並承辦註冊會計師業務的機構。註冊會計師執行業務，應當加入會計師事務所。在我國可分類為有限責任公司、合夥制兩種形式，在國外還有有限責任合夥制(LLP)。會計師事務所的基本職能就是依據這些法律、法規和政策，對市場微觀主體的行為和經營結果進行規範調整，從而使國家的意誌在社會經濟活動中得到實現，使“法制”過渡到“法治”，“以法治國”轉變為“依法治國”，把企業的經營活動納入法治軌道，最終達到社會資源充分利用和優化配置的目標。因此，會計中介機構在國家經濟政治生活中起著重要作用，擔當著不可替代的角色。