企業財務會計與預算會計的區別主要在三個方面:
1.會計主體的微觀本質
企業財務會計以企業為主體，會計內容只能是企業的經濟活動。凡是與企業經濟活動有關的、屬於對方的會計內容，都不應在企業中核算，這也是企業會計主體固有的定性規定；預算核算是圍繞整個國家預算的執行而組織的，既核算各種非物質生產部門的預算收支，又核算物質生產部門的經濟效益和上繳利稅。
2.會計流程的復雜性
企業財務會計的核算過程涉及到供應、生產、銷售三個過程，每個過程又涉及到收付兩個方面，核算過程復雜；而預算會計的核算過程只涉及預算收入和預算支出，沒有生產和銷售環節，核算過程相對簡單。
3.會計目的的盈利能力
企業財務會計的最終目標是通過會計核算使企業以最少的資本支出取得最大的經濟效益；預算會計的目的是反映預算收支政策的執行情況，而不是盈利。