運輸公司的會計做賬方法如下：
1、運輸業會計核算運輸收入時：
借：銀行存款；貸：主營業務收入——：運輸收入；應交稅費：應交增值稅（銷項稅額）
2、結轉運輸成本時：
借：主營業務成本；貸：應付職工薪酬；銀行存款（租車費或油費等支出）。
運輸會計：
是指以貨幣為計量單位對交通運輸企業的經濟活動及其成果進行核算與分析，作出預測，實行監督的壹種專業會計。按會計所特有的方法，即通過設置賬戶、復式記賬、填制和審核憑證、財產清_、計算成本、編制決算等手段。
正確地反映、嚴密地監督、全面地分析運輸企業的資金運作，借以加強計劃管理和經濟核算，貫徹節約原則，提高經濟效益，保護財產，並為經濟預測和經濟決策提供數據。
運輸業會計核算運輸收入，然後結轉運輸成本，應當通過“主營業務收入”相關二級科目以及“主營業務成本”等科目核算。主營業務收入是指企業從事本行業生產經營活動所取得的營業收入。主營業務成本是指企業銷售商品、提供勞務等經營性活動所發生的成本。