醫院會計所用會計科目有：資產類、負債類、基金類、收支類科目。
1、資產類：
反映醫院全部資產狀況的總賬科目，按資金的流動性強弱，分為“現金”、“銀行存款”、“其他貨幣資金”、“應收票據”、“應收在院病人醫療款”、“應收醫療款”等科目。
2、負債類：
反映醫院全部負債狀況的總賬科目，按不同的債權人和債務類型，分為“短期借款”、“應交款項”、“應付票據”、“應付賬款”、“預收醫療款”等科目。
3、基金類：
反映醫院全部基金狀況的總賬科目，按基金的用途，分為“事業基金”、“專項基金”、“待沖基金”、“待沖財政基金”、“待沖科教項目基金”等科目。
4、收支類：
反映醫院全部收入和費用支出狀況的總賬科目，按收入的來源和支出和去向，分為“醫療收入”、“醫療業務成本”、“其他收入”、“其他支出”等科目。