企業要做好企業所得稅匯算清繳工作，應在準確會計核算的基礎上，註意以下幾個問題。 在系統安裝後首次輸入企業信息的時候要仔細填寫企業的基礎信息，包括企業的行業、經濟性質、核算方式即就地繳納還是匯總繳納等，這些基礎信息都要填寫，而且要和稅務登記信息即稅務局的CTAIS中登記信息壹致，才能申報成功。企業在錄入數據的時候，每張表格包括主表、附表和財務報表都要填寫，沒有數據的就填零。特別是財務報表的期初和期末數都要填，而且資產負債表的期初數不能為零。有些企業的資產負債表的期初數都填零，結果不能打包通過，新開戶的企業資產負債表的期初數就填寫企業開業時的經濟狀態，記住不能零。在申報表的主表中，如果企業是虧損的，在應納稅所得額這壹欄不能填負數，應該填0。
全面實施小企業會計準則與營改增試點後，為了幫助企業正確納稅申報，減輕小企業減輕稅負，通過對籌資，投資和經營活動的合理策劃，為企業創造效益，幫助企業在向稅務機關順利完成納稅申報，結清企業所得稅稅款。暢捷通會計家園舉行了壹系列的關於匯算清繳的專家視頻講座，其中有國家稅務部門的專門親自坐鎮，為企業支招，就企業關註的熱點話題現場講解，其中有陽光節稅，合同與納稅，小企業稽查風險防範等講座，另有多名專家線上互動答疑，幫助財稅人員學習和進步。同時在問答區開僻有稅收相關的專欄，眾多知名財稅專家為企業解讀匯算清繳的政策及問題。