國庫主任負責組織領導轄區內國庫會計工作，是國庫風險的第壹責任人，負有主要領導責任；國庫部門負責人負責組織管理轄區內國庫會計工作，對國庫資金風險負直接領導責任；國庫會計主管負責組織管理本部門會計人員準確及時辦理會計業務，審批重要會計事項，及時處理和報告會計核算中發現的問題；國庫會計人員按照崗位職責的要求，嚴格執行國庫會計的各項制度，準確、及時地核算業務。
第十五條國庫會計實行崗位責任制。國庫會計崗位的設置和分工以相互制約、保證資金安全為原則，壹人壹崗、壹人多崗或壹崗多崗，確保崗位之間分工嚴格、相互銜接；國庫會計不得越權辦理業務，嚴禁“壹手清賬”；國庫會計資金往來使用的印章、密鑰和重要空白憑證應當嚴格執行。
第十六條各級國庫應當設置資金結算記賬崗、明細核算記賬崗、復核崗、綜合核算崗、同城票據交換崗、系統維護崗和會計主管崗。
國庫會計應由專門機構或人員進行事後監督。
經國庫部門負責人同意，國庫會計可以書面授權相關人員辦理其負責的國庫會計管理業務，但不得違反第十五條的規定。
第十七條國庫會計的重要事項應當實行審批制度。國庫會計重要事項包括:國庫會計人員加班、影響會計核算的系統參數維護、系統升級、系統數據恢復、查詢回復、補充憑證和回單、手工填制轉賬憑證劃轉資金、暫付款掛賬、暫付款提取、補充核算、錯賬更正及其他需要審批的事項。
國庫會計的重要事項應當經國庫會計主管人員審批或者登記。