具體到會計學而言，會計碩士屬於專業學位碩士;會計學碩士屬於學術型碩士。兩者培養目標和培養方式有所不同，後者以培養具備科研能力的人為主，會計專碩簡稱MPAcc，培養目的是系統掌握現代會計理論與實務以及相關領域的知識和技能，具備會計工作領導能力的高素質會計人才。
會計專業碩士與會計學碩士，各有側重，其招生辦法、教育內容、培養模式、質量標準等需要突出職業要求，註重學術性與職業性的緊密結合。
區別會計學碩士會計專業碩士
培養模式不同：主要以理論教學為主，學制壹般為三年。主要以案例式教學、研討式教學、強調團隊合作、註重培養創業型、職業化素質，學制壹般為兩年。
培養方式不同：從2014年起，所有納入國家招生計劃的新入學研究生實行自費，同時輔以合理的獎助金。會計專業碩士主要以自費培養模式為主，設有部分獎學金。
課程設置不同會計學碩士更多偏重於基礎教育、素質教育和專業教育，偏重理論知識的掌握和學習，如財務理論、會計理論、審計理論、國際會計等會計相關知識。會計碩士更多偏重於實務，學習的目的是為了解決實際工作中的問題。
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