有關機關受理備案申請後，對納稅人提交資料齊全、符合法定形式的，受理備案申請。對逾期備案納稅人，受理人員按照有關規定，可以處以罰款。
依法不屬於本機關職權或本業務受理範圍的，告知納稅人不予受理的原因。納稅人提交資料不全或不符合法定形式的，壹次性告知納稅人需補正的內容。辦理財務會計制度備案需要壹定的條件：
1、從事生產、經營的納稅人應當自領取稅務登記證件之日起15日內，將其財務、會計制度或者財務、會計處理辦法等信息報送稅務機關備案。
2、納稅人使用計算機記賬的，還應在使用前將會計電算化系統的會計核算軟件、使用說明書及有關資料報送主管稅務機關備案。
3、非境內註冊居民企業應當按照中國有關法律、法規和國務院財政、稅務主管部門的規定，編制財務、會計報表，並在領取稅務登記證件之日起15日內將企業的財務、會計制度或者財務會計、處理辦法及有關資料報送主管稅務機關備案。
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法律依據：
《中華人民***和國稅收征收管理法》
第二十條
從事生產、經營的納稅人的財務、會計制度或者財務、會計處理辦法和會計核算軟件，應當報送稅務機關備案。
財務制度備案指的是企業在啟用或變更財務制度後，於當地主管稅務機關進行財務制度網上同步變更的行為。