1，定義不同。工程財務會計需要熟悉建築企業會計制度的內容，註意成本費用的歸集和分配方法。基礎會計是指會計事項的記賬基礎，是會計確認的標準方式，也是單位收入、支出、費用的確認標準。
2.會計處理不同。工程財務會計按成本核算對象和成本項目分類。其中，人工費、材料費、機械使用費、其他直接費等。，均直接計入相關項目成本，間接成本可先在本科目設置“間接成本”進行核算，月末再按壹定比例進行分配；基礎會計按照權責發生制和收付實現制進行會計處理，不同準則下的收入和費用計入不同科目。