1，文檔文件
檔案室收集、整理、分類文件資料——錄入機讀目錄——整理文件檔案——整理裝訂文件檔案——制作檢索工具——入庫——分類上架。
2.會計檔案
會計室兼職檔案員按規定整理會計檔案——將整理好的會計檔案移交給會計室檔案室——雙方填寫檔案移交登記表——檔案入庫——會計室兼職檔案員對會計檔案進行分類，管理會計檔案櫃鑰匙。
3、儀器文件
各部門購置1萬元以上的設備，由相關部門兼職檔案員向院檔案室移交設備資料——雙方填寫檔案移交登記表——檔案保管。