註冊會計師在信息化環境下面臨的挑戰有:(1)對業務流程開發和內控運作的理解；(2)了解與信息系統相關的審計風險；(3)審計範圍的確定；(4)審計內容的變化；(5)隱藏審計線索；(6)改進審計技術的必要性；(7)知識結構有待優化；(8)全力配合專業團隊。