壹、辦公室
擬訂機關年度工作計劃、有關工作制度及長遠發展規劃；起草和審核重要文稿；負責機關文電、機要、會務、檔案、督辦、保密、密碼等工作；
二、人事教育科
組織落實幹部人事管理制度；承擔機構編制、幹部任免、人員調配、勞動工資、人事檔案、公務員管理、專業技術職務管理等人事工作；監督檢查執行幹部人事規章制度情況；管理機關外事工作；組織實施機關精神文明建設、稅務文化建設和基層建設；擬訂並組織實施人員培訓、學歷教育工作規劃、年度計劃，開展培訓質量考核與評估；落實上級巡視相關工作；承擔機關離退休幹部的服務和管理工作。
三、監察室
組織落實紀律檢查、行政監察工作制度，擬訂具體實施辦法；組織協調本系統的黨風廉政建設和反腐敗工作；受理對機關工作人員違法違紀行為的檢舉、控告及有關申訴；查處機關工作人員違法違紀案件及其他重要案件；負責來信來訪的落實工作；開展執法監察和糾風工作；負責局目標管理考核工作。
四、政策法規科
擬定並組織實施本局依法行政、依法治稅工作方案，負責本局普法教育的組織、落實工作。承擔重大稅收案件審理工作；辦理行政復議、賠償案件及行政訴訟案件；組織實施稅收法律法規、部門規章及規範性文件執行情況的監督檢查，承擔稅收執法質量考核工作；配合財政、審計等部門對稅務部門在稅收政策上的監督與審計工作。負責流轉稅、所得稅等稅種的稅政業務；負責增值稅專用發票及納入稅控系統的普通發票的管理；負責金稅工程的管理、推廣應用及金稅數據稽核管理工作。
五、征收管理科
組織落實綜合性稅收征管法律法規、部門規章及規範性文件，擬訂具體操作辦法；承辦征管質量考核、風險管理和稅收收入征管因素分析工作；承擔稅務登記、納稅申報、普通發票管理、稅收征管軟件應用、稅控器具推廣應用、委托代征代扣稅款等方面的相關工作；負責對納稅人涉稅告知短信內容的審核、公布工作；組織落實個體和集貿市場稅收征管、稅收管理員制度；負責稅務代理工作的監督、管理、指導、協調；承擔納稅信用評定工作。
六、稅源管理壹科
負責所轄範圍內流轉稅、所得稅等各稅種的重點、專項評估和重點專項稽核工作，落實上級機關部署的重點評估企業的納稅評估工作；牽頭組織開展行業、區域性或重點稅源專項納稅評估工作；推廣應用評估軟件，及時報送納稅評估案例及相關材料；負責註銷、遷移企業的各稅種稅款清算工作，負責對各稅源管理部門開展日常評估、日常稽核、日常管理性檢查工作的指導、監督。
七、稅源管理二、三、四科
負責對所轄納稅人的監控、管理和服務，調查核實納稅戶稅務登記及納稅申報、進行稅源預測和分析、稅收宣傳、納稅輔導、稅收調研、納稅服務、戶籍管理、政策送達、稅源調查、定額核定、催報催繳、數據采集分析、審批各類涉稅申請、處理壹般性違規違章行為等；負責流轉稅、所得稅等多個稅種的日常評估、日常稽核和日常管理性檢查工作。
另，四科負責國家進出口稅收政策及管理辦法的貫徹落實、日常監督檢查工作；負責出口貨物退免稅的審核和確認；負責出口貨物退免稅信息化管理系統的推廣應用和維護工作，編制出口退（免）稅計劃；負責貫徹執行國家涉外稅收法律法規，配合有關部門組織實施反避稅檢查；負責稅收協定執行、反避稅實施、涉外稅務審計、外國居民稅收監管、情報交換、國際稅務管理合作等；負責所轄外商投資企業、外國企業的稅源管理工作，組織實施特別納稅調整工作。
八、收入核算科
編制年度稅收計劃、免抵調庫計劃；監督檢查稅款繳、退庫情況；開展稅收收入分析預測、稅收收入能力估算及重點稅源監控、企業稅收資料調查工作；承擔稅收會計核算、統計核算、稅收票證管理等相關工作；承擔稅收收入數據的綜合管理應用工作；負責稅款緩繳、呆帳稅金、死欠稅款核銷、欠稅公告等管理工作。
九、納稅服務科(辦稅服務廳)
組織、協調和指導機關各部門、各稅種、各環節的納稅服務工作；組織實施納稅服務工作規範和操作規程；組織落實納稅人權益保障規章制度及規範性文件；組織協調、實施納稅輔導、咨詢服務、稅收法律救濟等工作，受理納稅服務投訴；指導稅收爭議的調解；承擔12366熱線、網站納稅服務欄目。
負責納稅人到稅務機關辦理的各種涉稅事項，具體包括稅務登記、納稅申報、稅款征收、稅款解繳、欠稅公告、發票購銷、稅法（宣傳）公告、金稅發售、發行、發票代開、報稅稽核、咨詢輔導和受理納稅人涉稅項目審批申請等工作。