新制度在預算會計科目中設置了“資金結存”科目，用以反映各結存類科目對應的資金形態。在“資金結存”科目下設置了“貨幣資金”、“零余額賬戶用款額度”及“財政應返還額度”三個明細科目。資金結存是核算單位納入部門預算管理的資金的流入、流出、調整和滾存等情況，本科目借方表示增加，貸方表示減少，年末借方余額，反映單位預算資金的累計滾存情況。