雜交水稻種子生產技術復雜。為了使雜交水稻制種高產優質，必須抓好以下關鍵技術:
(1)安全隔離。安全隔離是保證種子純度的關鍵措施之壹。雜交種子的純度直接影響雜交水稻種子的質量。因此，在整個種子生產過程中，必須認真落實安全隔離措施。隔離的方法有:
①空間隔離。隔離距離壹般丘陵地區50米以上，平原地區100米以上。
②時間隔離。制種田周圍非雄性品種的抽穗開花期與制種田的父本錯開20-25天以上。
③屏障隔離。因地制宜利用山地、村莊、林帶、果園等自然屏障，阻止外來花粉傳入。
④父系隔離。也就是說，在種子田規定的隔離範圍內種植同壹恢復系，既能起到隔離作用，又能擴大雄性花粉來源，有利於提高制種產量。
(2)安排適宜的抽穗開花期。不育系必須依靠恢復系的花粉才能受精結實。因此，制種田的不育系和恢復系能否安全抽穗開花，花期是否完全符合，是制種成敗和產量高低的前提。具體來說，要註意以下幾點:
①選擇安全的抽穗和花期。安全抽穗開花期是指制種田開花期的氣候條件有利於異交結實。雜交水稻制種父母本最適宜的氣候條件是:日平均氣溫23 ~ 30℃，相對濕度70% ~ 90%，晝夜溫差8 ~ 9℃，天氣晴朗，微風。如果日平均氣溫連續三天以上低於23℃或高於35℃，或連續三天以上陰雨連綿，或有長時間暴雨盛期，授粉受精都會受到影響。壹般來說，長江中下遊地區最適宜的花期是平原和丘陵地區的6月下旬至7月上旬，8月上旬至9月上旬，以避開7月的“火南風”和9月中下旬的“寒露風”；山區7月底至8月初，要安排早播，搶高溫，避低溫，充分利用溫光資源。南方雙季稻區可在春秋兩季安排制種，但要註意將春季制種花期安排在5月中旬，避開雨季。秋季制種花期在9月中旬。海南島南部從3月下旬到4月上旬和中旬是開花的好季節。北方粳稻制種區花期適宜在8月中下旬。
(2)保證父母符合這個花期。我國雜交水稻制種使用的野生敗育雄性不育系多由我國長江中下遊地區的溫敏型早稻品種轉育而來，生育期短。使用的恢復系都是來自東南亞的品種或從東南亞調入的品種，生育期長。兩者的生長期差別很大。因此，調整兩個親本的播期，使不同生育期的親本在這個花期相遇，是制種成功的關鍵。
生產中確定親本播期差的方法有三種:生育期法(時差法)、有效積溫法(溫差法)、葉齡差法(葉差法)。這三種方法在計算父母本播期差方面各有特點，各地可根據當地情況、季節和經驗選擇合適的方法。
③做好花期預測和調整。制種田間親本生育期的長短，不僅由親本的遺傳特性決定，還受氣候、土壤、栽培等因素的影響，導致比預定日期提前或推遲的現象，影響開花會。因此，要做好花期預測工作，壹旦發現沒有花期，要盡快采取措施進行調整。
預測雜交水稻親本花期相遇的方法有很多。比較準確可靠的方法是幼穗剝離法和葉齡差法，可用於分析。
通過花期預測，如果親本花期相差3天以上，要采取措施促進和控制，促進生長緩慢的親本，抑制生長快速的親本在花期相遇。在措施上，以促為主，促控結合，促控早(在幼穗分化第三階段前促控效果最好)，力爭主動。具體調整措施包括肥調、水調、化調。
(3)確定合理的苗穗結構。合理的群體結構是制種高產的基礎。建立制種高產群體結構的主要措施如下:
(1)培育適齡的強分蘗苗。適齡壯苗是提高有效穗的基礎。堅持在秧田培育分蘗適宜的壯苗，依靠移栽代替大田發苗，依靠主莖和低節位的壯蘗形成基本苗，是增加單位面積基本苗數，實現滿穗的重要措施。
②安排合適的排比。擴大行比是增加母本有效穗數的重要方法之壹，也是制種高產的主要技術。行比取決於親本的生育期和分蘗能力的強弱。壹般早中熟組合為2 ∶ 12 ~ 14，晚熟組合為2 ∶ 16 ~ 18。近年來，各地在大力培育父本壯苗的基礎上，將兩行父本改為單行，行比改為1: 12或1: 14，進壹步提高了母本比例。
③合理密植。合理密植不僅可以增加單位面積的基本畝數，保證合理的群體結構，獲得足夠的有效穗，還可以抑制無效分蘗，使植株生長整齊，抽穗集中，有利於授粉。壹般合理密植的規格是:親本行距10 ~ 11cm×13 ~ 16cm，父本插兩行，行距13cm× 16 ~ 20cm。
④加強現場管理。在田間管理的前期，要著眼於父母本群體的早期生長和快速發育，及早獲得足夠的分蘗苗。在施足基肥的基礎上，早施分蘗肥，勤灌淺水促分蘗，補死苗，親本管理並重，快速架設高產秧架。中期以父母本穩長為主，爭取壯根、壯稈、中穗、短葉。施肥采用集中控制的原則，尤其是氮肥的施用。同時，要及時排田，用水調肥，抑制無效分蘗的發生；復水後要適量施磷鉀肥，使葉片直壯，提高群體通透性，加強病蟲害防治。後期主攻提高每穗粒數和粒重。在施肥技術上，應輔以強尾肥，即在抽穗前5 ~ 7天施速效氮肥，使後期生長不致過早。按照“滿水抽穗，晾曬催熟”的技術進行水分管理。同時結合噴施920，做好葉面施肥和病蟲害防治，提高異交結實率和粒重。
(3)采取綜合措施提高母本異交結實率。在壹定的苗穗範圍內，種子產量主要取決於母本的結實數。影響異交結實率的因素很多，如制種田花粉密度低、不育系穗粒暴露率(頸蓋)低、親本花期不遇等。提高異交結實率的技術措施主要有:
(1)科學使用920。在種子田噴施920不僅能拉長母本穗頸，解除母本的頸包，提高穗粒暴露率，而且能增加種子的千粒重。920的施用方法要“適時、適量、適當”“適時”是指當達到抽穗指數(5% ~ 10%)時，最好選擇晴天，在上午9點前或下午4點後噴施。“適量”是指92075 ~ 150克/公頃用於種子田，噴水3次，每天1次，連續3天。三次用量分別占總用量的20%、30%和50%。“適宜法”要求田間有6厘米左右的水層，用手持電動微型噴霧器噴灑，噴頭距離穗層30厘米左右。
(2)讓父母相見。由於父本開花早且密集，母本開花晚且分散，此時應采取措施督促父母相見。調節開花時間的方法有:
A.趕走露水，趕走母親但不趕走父親。即在陽光明媚的早晨，趕走聚集在母本葉片上的露水，可以降低穗層的濕度，提高溫度，使穗松散，促進母本提前開花。
B.噴冷水，噴父不噴母。每天下午4 ~ 5時，在父本穗部噴冷水375公斤/公頃，以增加父本穗層濕度，降低溫度，延緩父本開花時間。
c、噴施雕花靈或硼肥。向母本噴灑調靈可導致提早開花。抽穗40%、80%時，每公頃向600公斤葉片噴水0.45公斤。從母本開始每三天噴施壹次硼肥，濃度為0.15% ~ 0.20%，有利於母本早開花。
③人工授粉。人工授粉可以促進花藥開裂，擴大散粉範圍，從而提高異交率。不如用竹竿抓粉，進行人工授粉。要輕壓、輕搖、慢放。軟壓是順著風向輕輕壓父本植株中部，使果穗偏向母本撒粉；復振是指連續振動水稻植株，使花藥開裂散粉，飛離母系；緩釋是為了防止花粉飛回來。壹般在母本抽穗達到50%左右時開始，雙親開花時每天進行，連續進行3 ~ 4次。我們應該堅持摘花，直到它們都結束。
(4)抗雜保純，保證種子質量。
(1)嚴格去雜質去劣。為了保證純度，除了隔離，還要認真做除雜。要求分別在苗期、分蘗期、抽穗期、成熟期進行，雜株、劣株全部清除。特別要註意把可能與不育系混在壹起的保持系拔出來。
(2)嚴格按照生產程序操作。在種子生產的整個過程中，要嚴格遵守操作規程，防止機械攪拌。浸種催芽、播種育秧、拉運苗、移栽苗、收割，要分部門、分階段專人進行。尤其是收割的時候，最容易造成機械混亂。需要先收獲母本，再收獲父本。單收、單收、單曬、單儲。倉庫要有專人管理，種子曬幹後要包裝好，做到種子與標簽相符，處處保證防雜關。