1950年9月，吉林財經大學前身東北銀行專門學校在長春誕生，其中設有會計、統計兩個專科專業。
1961年，學院增設會計、統計兩個本科專業，建立會計統計系，
從1962年開始招生；
1986年10月會計統計系分設，組建會計系，下設會計學專業；
1988年增設審計專業；
1996年成立現代會計研究所；
2000年增設財務管理專業。
2014年增設資產評估專業。