壹、私立醫院的會計核算
新《醫院會計制度》、《基層醫療衛生機構會計制度》沒有明確規定。在會計界，有人認為應執行《基層醫療衛生機構會計制度》，有人認為應執行《小企業會計準則》。
二、私立醫院的會計科目設置
《基層醫療衛生機構會計制度》規定，設置和使用會計科目，在不影響會計處理和編報會計報表的前提下，可以根據實際情況自行設置本制度規定之外的明細科目，不需要的科目可以不設置。基層醫療衛生機構不得將會計科目編號隨意打亂重編。
《小企業會計準則》規定，小企業在不違反會計準則中確認、計量和報告規定的前提下，可以根據本企業的實際情況自行增設、分拆、合並會計科目。小企業不存在的交易或者事項，可不設置相關會計科目。對於明細科目，小企業可以比照附錄中的規定自行設置。會計科目編號供企業填制會計憑證、登記賬簿、查閱會計賬目、采用會計軟件系統參考，企業可以結合實際自行確定其他會計科目編號。
根據上述規定，結合私立醫院的實際情況，設置適用的會計科目和明細科目。私立醫院設置的會計科目，大體可分為五大類，即資產類、負債類、所有者權益類、收入類及支出類。
三、私立醫院的性質
根據私立醫院的單位性質和業務範圍，其實質屬於事業單位企業化管理的經濟組織形式，其會計核算應以《基層醫療衛生機構會計制度》為基礎，參照《小企業會計準則》的規定進行會計核算。