1、審計人員綜合素質不高
壹方面，審計是需要註冊會計師的經驗和知識進行職業判斷的行業，但是現代審計內容越來越復雜，越來越廣泛，既包括對被審計單位經營成果分析，又包括對內部控制制度健全與運作效果進行評價，而註冊會計師的經驗和能力的是有限的，因此審計工作不可能達到壹種完美的效果，特別是對於剛剛從事審計工作的人員，需要在審計工作中不斷積累經驗和能力。即便是長期從事審計工作的人員，面對復雜的業務，也難免做出不恰當的判斷。另壹方面，審計是壹種技術性很強的服務，要求註冊會計師具有高尚的品德、高度的職業關註、紮實的專業技能和準確的判斷力，但是部分註冊會計師缺乏應有的職業道德，未能保持應有的職業謹慎態度，未能對被審計單位的內部控制制度進行有效的評估，從而加大了審計風險，導致審計失敗。
2、審計方法的局限性
由於審計內容的廣泛性和復雜性.受審計成本限制，不能將審計事項全部查清。因此，現代審計廣泛采用抽樣審計，根據樣本推斷總體特征，這就導致審計活動的結果必然存在誤差。此外，根據成本效益原則，註冊會計師會放棄那些耗時費力但對整體審計影響不大的審計程序，或者對壹些固有風險、控制風險大的項目選擇的樣本量過小，從而進壹步使審計意見失實，也就是說，實施抽樣審計意味著註冊會計師對審計風險有壹定的可接受水平。
3、被審計單位的原因
被審計單位自身的內部控制管理雖然對財務管理工作在某些方面起著積極作用，但是部分企業內部控制不嚴，進而將影響會計報表的真實性從而加劇審計風險。如果企業管理人員重視內部控制，良好的控制環境將有利於保障公司財務安全，保證會計報表的可靠性，從而降低了註冊會計師的審計風險，相反控制風險將會加大。此外，部分公司的經營活動不規範，投機心理促使壹些企業粉飾財務報表，在會計工作中故意舞弊，對註冊會計師的審計工作不予配合，甚至賄賂審計人員等，這也給審計人員工作帶來難度，審計風險也將會加大。
4、審計技術局限性的影響
在審計方法上壹般采用抽樣審計,這就加大了審計的潛在風險
現代審計廣泛采用的抽樣技術,即根據審計抽樣樣本的特征來推斷審計對象總體的特征,這種方法雖然可以提高審計效率,但用樣本的審計結果去推斷審計總體的實際情況必然存在誤差，這就加大了審計風險。采用抽樣審計抽樣,受審計人員經驗水平限制,抽樣時可能出現:壹是對被審單位壹些固有風險、控制風險大的項目選擇的樣本量過小;二是只求樣本數量,不求質量,如存貨審計,往往只對存貨的品種數量進行抽樣,而忽視對存貨的計價方法、質量、現行價格、所有權等方面進行審核,因而可能使審計人員對存貨的真實性、完整性做出誤判。
5、出於成本與效益的考慮
由於現代審計方法強調成本和效益原則,而審計風險和審計成本存在壹定的反比關系,在審計過程中,審計人員可能會舍棄壹些對審計結論影響不大但耗時費力的審計程序,如降低審計查證的數量,以降低審計成本,從而使審計風險增加。此外,現代審計模式建立在對內部控制評估或審計風險評估的基礎上,通過對內部控制制度的評估確定存在的控制風險,從而確定實質性測試的範圍和測試的規模,作為最終發表審計意見的依據。然而允許存在壹定的審計風險是運用現代審計模式的前提。