①審計的目的不同，內部審計評價內部控制的有效性、財務信息的真實性和完整性等。附註審計審計被審計單位財務報表的合法性和公允性。
②獨立性不同。
③接受審計的意願程度不同。
④遵循的審計標準不同。內部審計準則和註冊會計師審計準則
⑤審核時間不同。內審時間靈活，審核將定期進行。
註冊會計師應當充分了解內部審計工作的內容，並可以考慮使用其工作成果。
原因:
①內部審計是單位內部控制的重要組成部分。
②內部審計和外部審計在工作性質上是壹致的。
③利用內部審計的結果，可以提高工作效率，節約審計費用。