醫院堅持“科教興院”的戰略方針，引進了16排高分辨率環保型螺旋CT、全自動生化分析儀、多功能數字減影胃腸機、奧林巴斯電子胃腸鏡、鈥激光治療系統、C型臂機、生命體征監測儀、呼吸機、血凝儀、血液透析機等100多臺具有國際先進水平的現代化儀器設備，每年開展30多項新技術和項目。院內學術氛圍濃郁，人才梯隊合理。泌尿外科的診療水平在南通處於領先水平。消化科在治療上消化道出血和重癥胰腺炎方面處於同級醫院前列。
心血管內科自20世紀80年代初開始在南通地區開展臨時和永久起搏治療，心血管介入射頻消融技術在省內同級醫院處於領先水平。骨科、普外科、婦產科、神經內科、五官科等。均為市重點專科，技術實力在市內及周邊處於領先水平。微創外科、醫療美容、皮膚科、鎮痛等專科推出了各種特色醫療服務，較好地滿足了廣大患者的需求。
醫院加強質量管理，“以病人為中心”，大力加強內涵建設。圍繞創建“溫馨服務工程”和“十佳醫院”的要求，醫院科室全方位開展優質服務創建活動。從1998開始，實行“全年無休”、“病人選醫生”的工作制度，在各住院病房推行“病人名單制”、“醫患談話”、“家屬探視”等制度，改革病房排班制度。在門診設立患者服務中心，設立便民門診，組建專職導醫和運送隊伍。自2005年3月以來，包括副主任醫師在內的近百名專家攜手開展了“周日專家義診”活動，大大提高了服務滿意度，贏得了患者和社會的廣泛好評。2002年、2003年、2004年，醫院連續三年被評為“全市兩個文明建設先進集體”，榮獲“南通市衛生系統醫療安全先進單位”、“南通市首屆文明誠信窗口單位”等稱號。
為滿足人民群眾日益增長的醫療服務需求，醫院加快了基本現代化建設步伐，歷時四年多的老醫院改造初見成效。診療區均配有中央空調、中央吸引、中央供氧、有線電視、電話、病室衛生設施等現代化設施，診療環境溫馨舒適。硬件設施在蘇中蘇北同級別醫院中處於壹流水平。在醫院總支的領導下，全院幹部職工團結協作，改革創新，實事求是，開拓進取，努力建設花園式現代化醫院。