在預付業務較少的企業，預付款項也可以通過“應付賬款”科目核算。企業預付貨款時借記應付賬款，收到購貨款後沖減。但是，在這種方法下，應付賬款的某些明細賬戶中可能會出現借方余額。期末，應付賬款明細分類賬的借方余額應作為資產項目列示在資產負債表中，各明細分類賬的貸方余額應作為負債列示。
預付款多的企業需要為每個客戶建立明細賬，列出預付款日期、采購商品的規格和數量、預付款金額、到貨日期和取消日期。
企業的預付款項不得計提壞賬準備。但如有確鑿證據表明企業預付款項的性質發生了變化，或因供應商破產或被撤銷而無希望收到所購商品，應將原計入預付款項的金額轉入其他應收款，並按規定計提壞賬準備。