1、性質上的不同
mpacc全稱為會計專業碩士，我國的會計專業碩士是院校根據會計這壹專業所設置的壹項專業學位。mpa全稱為公***管理專業碩士，我國的公***管理專業碩士是院校根據公***管理這壹專業所設置的壹項專業學位。
2、入學考試內容的不同
由於會計專業碩士與公***管理專業碩士同屬於管理學專業碩士的範疇，因此兩者初試科目的內容都壹致，壹般都為《管理類綜合能力》、《外國語》，而由於兩者在人才培養方向上的不同，因此兩者復試的內容也有壹定的差異，復試由院校自主命題。
3、授課內容的不同
會計專業碩士的課程壹般包括《管理經濟學》、《財務會計理論與實務》、《財務管理理論與實務》、《管理會計理論與實務》、《審計理論與實務》、《管理信息系統》、《商業倫理與會計職業道德》等。公***管理專業碩士的課程壹般包括《社會主義建設理論與實踐》、《公***管理學》、《政治學》、《公***經濟學》、《公***政策分析和行政法》、《定量分析方法和信息技術應用》。