在財政直接支付模式下，獲得財政補貼的程序是:事業單位需要支付財政資金時，應當根據部門預算和資金使用計劃，向財政部門申請直接支付。經財政部門審核後，由財政部門通過財政零余額賬戶直接將款項支付給收款人。因此，事業單位在收到財政零余額賬戶代理銀行委托財政部門下達的財政直接支付通知時，應當按照實際發生的財政支付金額確認財政補貼收入。即在財政直接支付模式下，事業單位在實際使用財政資金的同時確認財政補助收入。
2.財政授權支付模式下財政補貼收入的確認和計量。
在財政授權支付模式下，獲得財政補助收入的程序是:事業單位根據部門預算和支付計劃，按照規定的時間和程序向財政部門申請財政授權支付額度。財政部門審核後，財政授權支付金額將到達該機構零余額賬戶代理銀行。財政授權支付方式下機構收到的款項金額可用於結算支付。因此，事業單位收到本單位零余額賬戶代理銀行的財政授權支付通知時，應當按照通知所列支付金額確認財政補貼收入。事業單位收到的款項不是實際的貨幣資金，在商業銀行開立的單位零余額賬戶也不是實際的資金賬戶，而是待結算的過渡性賬戶。