核算方法
財政部1997年6月頒布的《財政總預算會計制度》設置“預算結余”科目對預算結余進行核算。
年終，財政部門應將全年的“壹般預算收入”、“補助收入--壹般預算補助”、“上解收入”、“調入資金”等科目的期末貸方余額，轉入“預算結余”科目的貸方，即，借記“壹般預算收入”、“調入資金”等科目，貸記“預算結余”；
將全年的“壹般預算支出”、補助支出（壹般預算補助）、上解支出等科目的期末借方余額，轉入“預算結余”科目的借方，即，借記“預算結余”科目，貸記“壹般預算支出”、“補助支出--壹般預算補助”、“上解支出”等科目。
經本級政府批準，從本級政府預算結余中設置或補充本級預算周轉金時，按設置或補充數額，借記“預算結余”科目，貸記“預算周轉金”科目。
“預算結余”科目的年終貸方余額，反映本年的預算滾存結余（含尚兌付的有價證券），轉入下年
2資金管理
管理的重要性
通過近幾年的努力，中央各部門和單位已普遍對結余資金形成原因、產生的影響以及清理的重要意義有了深刻的認識，在提高預算執行率、消化結余資金方面有了壹定的改進。但總體情況看，部分單位對結余資金管理的政策還存在認識上的局限，還持有觀望和僥幸心理。因此，必須統壹思想，提高認識，充分認識在當前形勢下加強結余資金管理的重大意義。
首先，要充分認識加強結余資金管理是改進公***財政管理的重要內容。公***財政是財政管理和改革的方向和目標，是實現財政資金配置效益的根本保證。當前結余資金存量過大的問題，壹方面反映出預算單位預算執行力弱化的情況，另壹方面則在壹定程度上反映出財政資金配置合理化的問題。
其次，要充分認識加強結余資金管理是改進預算管理工作的重要手段。8年來，部門預算改革取得了長足的進展，為建立社會主義公***財政制度打下了堅實的基礎。走進新時期，面對結余資金這壹新情況新問題，也使我們反思：行政事業單位的預算編制內容還有待進壹步細化，預算編制方法還有待進壹步改進，預算編制水平還有待進壹步提高。因此，我們要從加強結余資金管理入手，以此作為升華管理的契機，不斷加強和改進預算管理工作的層次和水平。
最後，要充分認識加強結余資金管理是新形勢下行政事業單位財務精細化管理的重要內容。自2000年部門預算改革啟動以來，隨著國庫集中支付、政府采購、政府收支分類等改革的實施，中央部門財務管理改變了過去粗放式、“大雜燴”管理的方式，逐漸步入精細化管理的新階段。結余資金管理雖然只是財務管理的個別環節，但卻是整個財務管理鏈條的關鍵點，是管理的杠桿，牽壹發而動全身。因此，如能妥善解決好這個問題，勢必會從根本上改善單位的財務管理狀況。
形成的原因
由於行政事業單位的體制機制問題，結余資金的形成原因十分復雜，絕非朝夕形成。客觀地說，該問題的形成，既有行政事業單位管理體制和管理制度層面上的因素，也有預算編制和執行方面的原因，既有國家宏觀財政經濟政策的影響，也有單位內部加強管理、節約資金的效果，是各級各類行政事業單位比較普遍、長期存在的問題。歸納壹下，主要有以下幾個方面：
壹是財政財務政策方面的原因。由於國家對事業單位實行的是核定收支、定額或者定項補助、超支不補、結余留用的預算管理辦法，結余留用的資金可以提取職工福利基金和轉為事業基金，分別用於職工集體福利待遇、集體福利設施建設和彌補事業收支差額。在這壹政策的激勵下，許多單位積極挖掘內部潛力，努力增收節支，提高資金使用效益，節約了大量的財政資金用於事業發展，客觀上影響了預算的執行，促成了財政資金的大量結余。
二是預算管理體制方面的原因。主要是預算執行時間較短，各單位預算特別是項目支出預算很難在當年執行完畢，容易形成結余資金，結轉下壹年度繼續使用。
三是會計核算方面的原因。行政事業單位因往來款待結算的項目，雖然資金已經支付，但由於票據結算等方面的原因，在會計上不能做核銷處理，從而虛增了結余。另外，各單位對購買材料等消耗用品的支出，雖然資金已流出，但由於材料尚未使用也不能在會計上列作支出，從而在賬面上形成“虛擬”結余。
四是預算編制方面的原因。壹些單位由於編制預算不夠細化，甚至代編預算、虛報冒領財政資金，從而導致預算執行緩慢，預算資金滯留，這也是結余資金規模偏大的壹個重要原因。
解決的關鍵
完善制度建設是解決結余資金問題的根本保障。為進壹步加強結余資金管理，財政部已於2005年制定了《財政撥款結余資金管理暫行規定》，並於2006年修訂了該辦法。今後，應進壹步完善結余資金的分類管理方式、豐富監管措施、明確審核備案內容等制度，使結余資金管理更加規範化、制度化。
抓好預算編制是解決結余資金問題的關鍵。由於種種原因，目前各部門各單位在編制預算時還存在“頭戴三尺帽、不怕砍壹刀”的思想，還存在預算“報天書”的現象。同時，由於現行預算審核機制尚不健全，壹些項目在沒有有效的可行性研究報告和評審報告的情況下盲目上馬，也在壹定程度上造成了財政資金的大量結余。如何改進預算編制，簡而言之，應從以下幾個方面入手：第壹，要進壹步細化預算，盡快全面推行項目支出預算按經濟分類編制預算。第二，要加強項目可行性研究報告和項目評審報告管理。財政部門或主管部門要統壹組織對申報項目進行可行性報告和預算的評審工作，提高項目申報文本的質量。第三，要完善項目申報文本的功能，將其延伸為預算執行的重要依據。第四，要加強完工項目管理，專項支出決算實行審批管理。
健全激勵機制是解決結余資金問題的重要措施。消化結余資金，要建立科學、可行、有效的激勵機制，使各基層預算執行單位主動提高預算執行率。
3相關規定
財政國庫管理制度改革試點年終預算結余資金管理暫行規定
第壹條
為規範財政國庫管理制度改革試點年終預算結余資金的使用與管理，根據《中央單位財政國庫管理制度改革試點資金支付管理辦法》（財庫[2002]28號）、《財政國庫管理制度改革試點會計核算暫行辦法》（財庫[2001]54號）和《〈財政總預算會計制度〉暫行補充規定》（財庫[2001]63號）的有關規定，制定本規定。
第二條
財政國庫管理制度改革試點年終預算結余資金（以下簡稱結余資金），是指納入改革試點的預算單位（以下簡稱預算單位）在預算年度內，按照財政部批復的部門預算，當年尚未支用並按有關財政財務制度規定應留歸預算單位繼續使用的資金。結余資金包括行政事業單位經費結余、政府采購資金結余、留歸預算單位使用的項目經費結余、基本建設項目竣工和投資包幹結余，以及財政財務規章、制度規定的其他結余資金。
第三條
預算單位結余資金的數額按照財政部批復的部門預算數額加上年預算結余數額減當年財政國庫已支付數額和應繳回中央財政數額後的余額計算，並按規定程序由財政部核定。當年財政國庫已支付數額，包括財政直接支付數額和財政授權支付數額。財政授權支付數額為預算單位零余額賬戶已支用的用款額度。
第四條
預算單位應當按照財政財務規章、制度的規定，支用和管理結余資金。
第五條
預算單位結余資金應當按照以下程序核定：
壹、當年12月31日工作日結束時，代理銀行向基層預算單位提供對賬單對賬後，將各基層預算單位零余額賬戶額度余額註銷。下年度，代理銀行於1月第2個工作日將註銷的額度，以《財政支出年度報表》的格式（附表1），加蓋印章後報財政部國庫支付局。財政部國庫司於1月8日前（節假日順延，下同）向財政部部門管理司提供上年度預算單位實際支付的資金數額，部門管理司根據部門預算初步核定當年未支付的資金數額，將核定的數額於1月12日之前送達財政部預算司和國庫司。
二、各基層預算單位將本單位財政授權支付額度余額與代理銀行提供的對賬單核對壹致後，與財政直接支付預算結余壹同分預算科目類、款、項及項目，以《財政國庫管理制度改革實施單位年終預算結余資金申報核定表》（以下簡稱《核定表》，附表2）的形式將調整預算數額、用款計劃數額、實際支付數額、預算結余數額和申請結轉下年使用的預算結余數額（附基層預算單位與代理銀行的對賬單復印件），逐級匯總上報壹級預算單位；壹級預算單位匯總後於1月20日之前，按壹級預算單位匯總表和基層預算單位明細表的格式（包括電子文檔），報財政部國庫支付局和部門管理司各壹份。
三、財政部國庫支付局於2月5日之前將部門匯總報送的實際支付資金數額與代理銀行對賬單核對壹致後，分別按壹級預算單位和所屬各基層預算單位，將預算單位用款計劃數額、已支付數額、未支付數額送財政部國庫司。
四、財政部國庫司於2月底之前，按壹級預算單位，分預算科目類、款、項及項目，復核已下達的上壹年度用款計劃數額。復核無誤後，將《核定表》送各部門管理司和預算司。
五、財政部部門管理司根據部門預算和相關財政財務管理規定，於3月15日將上年度預算結余以正式文件（附核準的《核定表》）通知預算單位，並送財政部預算司和國庫司。
六、各壹級預算單位和基層預算單位將財政部核批的上壹年度預算結余與下年度預算合並使用，並將預算結余中未編報用款計劃的部分，與下年度預算合並編報用款計劃，由壹級預算單位匯總報財政部批復使用。
第六條
財政部核定下達預算結余之前，預算單位應當按照以下程序使用結余資金：
壹、代理銀行於當年12月31日將預算單位財政授權支付額度余額註銷後，於下年度1月第2個工作日，將上年度註銷的財政授權支付額度余額予以恢復，並通知各有關分支機構。各分支機構應當在1個工作日內向相關預算單位發出《財政授權支付額度恢復到賬通知書》（附表3）。
二、上年度註銷的財政授權支付額度在下年度無對應預算科目的，代理銀行應當根據財政部國庫支付局確定的科目對應關系進行調整後，恢復財政授權支付額度。
三、基層預算單位憑據《財政授權支付額度恢復到賬通知書》所列的額度支用資金。
四、預算單位支用上年度已批復用款計劃的財政直接支付結余資金，按照《中央單位財政國庫管理制度改革試點資金支付管理辦法》規定的程序申請支付，不再另行報送用款計劃。
五、預算單位支用上年度已批復部門預算，但尚未確定財政直接支付和財政授權支付方式、未編報用款計劃的資金，應當按規定程序確定支付方式，編報用款計劃，並經批復後支用。
第七條
財政部核定的預算結余數額如小於恢復的上年度財政授權支付額度與未支用財政直接支付用款計劃數額之和，預算單位應當報送負數用款計劃沖抵差額；不足以沖抵的，抵減當年預算。
第八條
上年度註銷的財政授權支付額在下年度無對應預算科目，需要變更款級科目的，財政部於下年度1月第2個工作日通知中國人民銀行（國庫局），由中國人民銀行（國庫局）相應調整支付清算的預算科目。
第九條 預算單位在財政部核定下達預算結余之前支用結余資金，應當遵守有關財政財務管理規章、制度規定。對違反有關財政財務規章、制度支用結余資金的，財政部應當責成其糾正，並可以通過扣減預算等方式繳回有關違反規定支用的資金。
第十條
代理銀行向財政部提供註銷預算單位零余額賬戶財政授權支付額度，應當準確無誤，並承擔相關責任。
第十壹條
財政總預算會計及國庫支付局會計按照《財政國庫管理制度改革試點會計核算暫行辦法》和《〈財政總預算會計〉暫行補充規定》（財庫[2001]63號）執行。
第十二條
年度終了，行政事業單位、建設單位根據代理銀行提供的對賬單按規定進行對賬。行政事業單位、建設單位年終會計處理按《關於2001年財政國庫管理制度改革試點單位年終結余賬務處理有關問題的通知》（財辦庫[2002]1號）進行相關註銷賬務處理，額度恢復時，作與額度註銷相反會計分錄處理。
第十三條
按有關財政財務規章、制度的規定，允許預算單位在年終結余資金中提取、支用的有關資金，預算單位應當進行相關提取、支用的賬務處理，並按規定支用資金。
第十四條
財政部核定下達預算結余後，預算單位根據財政部核定的上壹年度預算結余和下年度預算，按《中央單位財政國庫管理制度改革試點資金支付管理辦法》（財庫[2002]28號）的規定申請使用資金。會計處理按《財政國庫管理制度改革試點會計核算暫行辦法》（財庫[2001]54號）規定執行，並在年度決算報表中填加《財政性資金國庫集中支付撥款備查表》（附表4）。
第十五條
本規定從發布之日起實施。《財政國庫管理制度改革試點預算結余資金處理的有關規定》(財庫[2002]11號)、《財政部關於財政國庫管理制度改革實施單位年終預算結余資金處理工作的通知》(財庫[2002]70號)同時終止執行。
第十六條 本規定由財政部負責解釋。