隨著代理記賬行業的日益規範發展，代理記賬公司的收費標準也越來越透明。事實上，代理記賬公司的收費標準對於不同行業、不同性質的企業也是不壹樣的。壹般來說，代理記賬公司收費低的幾百元，高的幾千元。
1.增值稅納稅人的類型
壹般來說，增值稅小規模納稅人的財務工作相對簡單，所以他們的代理記賬費用相對便宜。現實生活中，壹般小規模納稅人的代理記賬成本在200-300元左右。
但由於普通納稅人記賬、納稅申報繁瑣，政府部門對其財務工作提出了更高的要求。所以壹般納稅人企業找代理記賬公司提供財稅服務，收費標準壹般在500-800元，明顯高於小規模納稅人。
2.企業所屬行業
代理記賬公司的收費也受行業影響。壹般來說，餐飲行業、電子商務等行業交易多，日常經營過程中涉及的票據、費用多且復雜，其賬務處理相對麻煩。
所以這些行業的企業推行代理記賬服務，其代理記賬費用會相對高於壹般企業。
3.企業尋求代理記賬服務。
目前國內的代理記賬公司可以為企業提供全生命周期的財稅服務。既包括記賬、報稅等基礎服務，也包括稅務籌劃、財務審計等增值服務。因此，代理記賬公司的收費標準也受到企業所尋求的代理記賬服務的影響。
壹般來說，企業如果尋求基本的代理記賬服務，壹年的服務費也不過幾千元。而企業如果尋求稅務籌劃、企業審計等財稅服務，成本會比較高，壹般達到幾千元甚至上萬元。