民辦學校非營利性質的按照《民間非營利組織會計制度》進行財務核算、營利性質的民辦學校按照《企業會計制度》進行財務核算。
比較常用的會計科目有：
資產類科目：包括現金、銀行存款、應收票據、對外投資、固定資產等二級科目；
負債類科目：包括應繳預算款、應交財政專戶、借入款項等二級科目；
所有者權益類科目：包括固定基金、事業結余、經營結余、事業基金、結余分配等二級科目；
收入類科目：包括財政補助收入、事業收入、經營收入、其他收入等；
損益類科目：包括事業支出、經營支出、成本費用、銷售稅金等科目。
具體的科目分類，還要根據民辦學校的具體經營來定。
《中小學校會計制度》（財預字[1998]104號）規定“本制度適用於各級人民政府舉辦的普通中小學校、職業中學、特殊教育學校、工讀教育學校、幼兒園、成人中學和成人初等學校。企業事業組織、社會團體及其他社會組織舉辦的上述學校參照執行。”
擴展資料：
會計報表應按期報送所有者、債權人、有關各方及當地財稅機關、開戶銀行、主管部分。有限責任公司的會計報表應分磅給各投資單位。股份有限公司的會計報表還應在股東會議召開20日之前備置於公司辦公處所，供股東查閱，公開發行股票的公司，應按財政部有關規定公告有關報表文件，月份報表應於月份終了後六天內報出；年度會計報表應在年度終了後四個月內報出。
企業向外報送的年度會計報表，應當由企業行政領導人、財務報表應當根據登記完整、核對無誤的賬簿記錄和其他有關資料編制、做到數字真實、計算準確、內容完整、報送及時。財務報表通常經註冊會計師審定。
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