1. 晁蓋與劉唐的對話，原劇情中，劉唐是由晁蓋引進梁山的，但後來晁蓋戰死，宋江又花樣作死，把劉唐給氣走了。
2. 魯智深和李逵的對話，魯智深和李逵在劇中都是粗人，但是魯智深急公好義，亡命之徒，李逵濫殺無辜，魯智深對李逵十分不滿。
3. 宋江潯陽樓題反詩的內容。原詩內容很長，而且句句要命，堪稱史上最狠的反詩。
4. 刪除了壹些梁山好漢的背景故事，比如原著中沒面目焦挺是相撲名家，但是電視劇裏面刪除了。
5. 盧俊義上梁山的部分原因被刪除，原著中盧俊義是因為被宋江等人的相撲戲弄，並且題了反詩才被官府抓住，後來被梁山好漢救出。
6. 壹些原本是綠林好漢的背景故事被刪除，比如錦毛虎燕順、矮腳虎王英、白面郎君鄭天壽等等。
以上是98版水滸傳刪減的部分內容。