相互聯系主要表現在投資決策的具體應用層面——技術分析必須有基礎分析支撐，避免“緣木求魚”，將技術分析和基礎分析納入進化分析的基本框架，提高其科學性、適用性、有效性和可靠性！
重要的區別主要體現在如何理解人與市場關系的哲學層面——技術分析師認為市場是對的，股價走勢已經包含了所有有用的信息，其基本思想是“跟隨趨勢，及時修正錯誤”；基本分析師相信自己的分析是正確的，市場錯誤經常發生。他們的基本思路是利用市場失誤的機會“低價買入，長期持有”；進化分析認為，無論從時間和空間上，還是從形式和內容上，判斷市場和投資者的對錯，都沒有壹個普適的、不變的、統壹的標準，而很大程度上取決於人性弱點和市場生態的共同進化過程。其基本思想是“壹切都是基於生物本能和進化規律的考慮”。
需要強調的是，由於機械論思維和各種先入為主的理論或方法的嚴重影響，投資者在股票交易決策活動中存在許多誤區和困境，其中最常見的誤區是復雜問題在認識論上簡單化，簡單問題在方法論上復雜化；主要的困境是，技術分析的有效性很正常，其科學性和可靠性受到廣泛質疑，而基礎分析的客觀性明顯“眾說紛紜”，適用性、準確性和可行性也受到嚴峻挑戰！
(1)，基本面分析:基本面分析以傳統經濟理論為基礎，以企業價值為主要研究對象，對決定企業內在價值、影響股價的宏觀經濟形勢、行業發展前景、企業經營狀況等進行詳細分析(壹般經濟學範式)，從而粗略計算上市公司的長期投資價值和安全邊際，並與當前股價進行比較，形成相應的投資建議。根據基本分析，準確預測股價波動軌跡是不可能的，只能買入股票，在有足夠安全邊際的情況下長期持有。[2]
(2)技術分析:技術分析是以傳統證券理論為基礎，以股票價格為主要研究對象，以預測股票價格的波動趨勢為主要目的，從股票價格變化的歷史圖表(數學或牛頓範式)入手，分析股票市場波動規律的方法的總和。技術分析認為市場行為包羅萬象，股價波動可以定量分析預測，如道氏理論、波浪理論、江恩理論等。
(3)進化分析:進化分析以進化證券理論為基礎，以股票市場波動的生命運動屬性為主要研究對象，從股票市場的新陳代謝、盈利性、適應性、可塑性、應激、多變性、節奏等方面(生物學或達爾文範式)入手，動態跟蹤市場波動的方向和空間，為股票交易決策提供機會和風險評估方法。進化分析從股市波動的本質屬性出發，認為股市波動的各種復雜因果關系或現象都可以從生命運動的基本原理中找到，它們之間的邏輯關系和合理解釋可以為股票交易決策提供令人信服的依據。