辦公室
全面處理局裏的日常事務。負責公文運作，組織重要會議，起草相關行政規章制度並組織實施；負責機要、通信、監察、信訪、保密和檔案管理工作；負責NPC代表書面意見和CPPCC委員提案的協調和督辦；負責政府信息公開、新聞宣傳和網站管理；負責財務和資產管理、對外接待、後勤保障和安全。
政策法規司
負責推進全面依法行政工作，審議本會起草的法律、法規、規範性文件和重大決定，以及全國人大代表意見和CPPCC提案答復；組織簽署相關法律法規，提交金融立法計劃；負責行政復議、行政訴訟、行政處罰聽證等工作；組織行政審批改革的相關工作；組織清理規範性文件；負責重大案件的審查和執法案卷評查；對金融執法的主體、事項和依據進行梳理和公示；對執法人員進行資格管理；執法文書統壹編制。
人事教育辦公室
負責市局機關及直屬事業單位的機構設置、職能調整和人員編制管理；負責人事招聘、調配、任免、監督、考核、獎勵、處罰、出國、工資福利、專業技術職務、人事檔案(資料)、離退休幹部等組織人事管理工作；制定並組織實施市金融系統教育培訓計劃。
信息技術司
編制本市金融系統信息化建設和應用規劃，並組織實施；制定金融信息化建設的管理制度、技術標準和規範；承擔財務管理應用系統的開發和數據利用管理；負責財務信息系統的運行、維護和安全；為金融改革和管理提供技術支持。
綜合規劃辦公室
綜合計劃處(綜合經濟研究室)研究制定本市中長期金融改革發展規劃並組織實施；組織管理本市金融體系研究工作，對綜合性、全局性的金融改革和發展進行前瞻性研究；參與研究制定本市金融綜合改革方案；參與研究制定本市財稅經濟政策；分析和預測本市宏觀經濟和金融發展形勢，提出綜合性宏觀調控政策建議。
金融監管辦公室
擬訂本市金融監管的政策和制度；監督財稅法律和政策的執行；檢查和反映財務收支管理中的重大問題，提出加強財務管理的政策建議；依法查處違反財經紀律的重點案件；監督檢查市局內部各部門及下屬單位執行財經法律、法規、政策和制度的情況。
預算局
編制年度市本級預算草案和預算調整草案；匯總編制區縣年度預算草案；分析和報告財政收支的執行情況；提出平衡財政收支的政策、措施和建議；制定市、區縣財政管理體制；負責市與中央、市與區縣之間的財務結算；制定市級財政預算管理制度；審查和批準市級部門預算，調整預算；制定本市非稅收入管理的相關文件；審批本市行政事業性收費；負責與市人大財政經濟委員會和預算工作委員會的溝通；配合審計部門做好財務審計工作；匯總地方政府債務，制定相關管理制度；制定鄉鎮財政資金監管辦法。
財政部
組織實施國庫管理制度、財政總預算會計制度和行政單位會計制度；研究實施本市國庫集中支付制度；負責市級財政資金的分配和調度；匯總編制市、縣、市財政決算，匯總行政事業單位決算；統壹管理市級財政銀行賬戶的開立和市級預算單位銀行賬戶的變更；負責地方債券發行管理；牽頭開展非稅收入征收管理、財政票據管理和公務用車管控。
政府采購管理辦公室
牽頭制定市政府采購制度政策，編制集中采購目錄草案；審批政府采購方式和方法的變化；負責政府采購評標專家、供應商、采購代理機構等政府采購事務的監督管理；市政府采購信息管理平臺的建設和管理；處理有關市政采購項目的投訴；負責采購信息公告和數據統計。
行政、政治和法律司
負責牽頭制定本市行政單位財務管理制度，制定相關財政資金管理辦法；聯系市委系統、市人大等部門和單位，審查其年度預決算和預算調整，分析預算支出執行情況，參與制定行政單位相關財務政策和制度；牽頭行政單位資產管理；負責管理國家機關定點飯店的招投標工作。
教科文組織辦事處
牽頭制定本市事業單位財務管理制度，制定相關財政資金管理辦法；聯系市教委、市科委、市科協等部門和單位，審核其年度預決算和預算調整，分析預算支出執行情況，參與制定事業單位相關財務政策和制度；牽頭事業單位資產管理；審查和監督體育彩票公益金和發行費的預算。
經濟建設司
負責制定本市基本建設項目相關財務管理制度和相關財政資金管理辦法；聯系市發改委、市建交委、市住房保障局等部門和單位，審核其年度預決算和預算調整情況，分析預算支出執行情況；負責對口部門和單位的資產管理。
農業部
農業廳(農業綜合開發辦公室)負責擬定農業財務管理制度和相關財政資金管理辦法；聯系市農委、市農場管理局等部門和單位，審核其年度預決算和預算調整，分析預算支出執行情況；負責對口部門和單位的資產管理；組織開展全市農業綜合開發項目、資金和綜合管理工作。
社會保障部
負責制定全市就業、社會保障、醫療衛生相關財政政策制度和財政資金管理辦法；制定社會保險基金、殘疾人就業保障金和福利彩票公益金的財務管理制度；聯系市人力社保局、市公務員局等部門和單位，審核其年度預決算調整情況，分析預算支出執行情況；負責對口部門和單位的資產管理；審核福彩中心彩票發行費收支預算。
企業事業部
負責制定本市企業財務管理制度和有關財政資金管理辦法；負責市本級國有資本經營預算；聯系市經信委、市商務委等部門和單位，審核其年度預決算調整情況，分析預算支出執行情況；負責對口部門和單位的資產管理；負責高新技術成果轉化等地方財政支持政策和企業政策性虧損補貼的審核；負責金融反補貼調查。
計算所
組織實施國家統壹的會計制度，指導企業事業單位規範會計核算；管理本市會計從業資格和人員、會計專業技術資格考試和高級會計師評價工作；指導和監督代理記賬機構；負責本市會計師事務所和資產評估師的設立審批和日常管理，並對市註冊會計師協會和市資產評估協會的工作進行指導和監督。
對外經濟辦公室
負責世界銀行、亞洲開發銀行和外國政府在本市合作項目的開發和管理，負責制定相關金融政策，監督貸款項目和財務管理；負責本市非貿易和非經營性外匯管理，外匯審批和核銷；負責涉外金融、雙邊和多邊合作及對外交流的綜合研究。
稅務管理部門
負責執行國家稅收政策；組織起草地方性稅收法規、規章草案、實施細則和稅收政策調整方案；研究提出運用稅收政策實施宏觀調控的建議；做好稅收政策執行情況的反饋和稅收信息調查；監督檢查稅收政策的執行情況；負責地方財政部門的關稅工作。
績效評估管理辦公室
負責制定財政支出績效評價的相關政策、制度和方法，制定績效評價指標和標準體系；組織預算編制、執行和財政資金使用的績效評價；負責績效評價中介機構和專家庫的建立和管理，並監督其評價質量；建立績效評價工作信息庫和績效評價結果應用機制。
檢查辦公室
負責市財政部門的紀檢監察和行政監察工作；監督檢查市財政部門及其工作人員執行國家財政稅收法律、法規、規章和有關政策的情況；受理對財政部門及其工作人員違法違規行為的檢舉和控告；負責金融部門的建設；承辦市紀委、市監察局交辦的其他工作。
直屬機關黨委
直屬機關黨委(工會、團委)宣傳黨的路線、方針、政策，開展思想政治工作；負責黨的基層組織建設；負責黨內監督；組織黨員的教育、管理、服務和發展；負責統戰工作；推進學習型組織建設；組織工會和團員青年的工作；指導基層單位的相關業務工作。