如果妳的培訓協議中約定的培訓內容是內部培訓，而用人單位未能提供證據證明培訓費支出，要求扣除培訓費沒有依據，妳可以請求仲裁返還被扣除的工資。壹般仲裁都會支持。
勞動合同法
第二十二條用人單位為勞動者提供專項培訓費，為其提供專業技術培訓的，可以與勞動者訂立協議，約定服務期限。
勞動者違反服務期約定的，應當按照約定向用人單位支付違約金。違約金的金額不得超過用人單位提供的培訓費用。用人單位要求勞動者支付的違約金不得超過服務期未完成部分應分攤的培訓費用。
用人單位與勞動者約定服務期的，不影響勞動者在服務期內按照正常的工資調整機制提高勞動報酬。