1，缺乏統壹的組織領導。目前農民教育培訓沒有統壹的培訓計劃，培訓工作基本處於無序狀態。農民教育培訓體系不健全，教育培訓資源沒有整合，教育培訓內容沒有根據農民的要求進行調整，農民夜校發展沒有完成，缺乏指導服務。
2.缺乏穩定的經濟來源。夜校的運營沒有固定的資金來源，農民夜校的發展也沒有政策支持。導致農民夜校的組織形式不夠新穎和吸引人，開展夜校的方式、方法和手段不夠創新，基礎設施建設不夠完善，缺乏有效的激勵和約束機制。同時，農民夜校師資不專業，缺乏針對性的夜校教材和讀本，如目前發展農家樂、民宿、特色物種養殖缺乏專業的師資和教材。