1.樣品制備不當:樣品制備過程中存在樣品質量差、濃度過低或過高、聚集等問題。這些問題使得在電子顯微鏡下不可能獲得樣品的清晰圖像。
2.冷凍過程不正確:在冷凍過程中，需要控制樣品的溫度和速度，以保證樣品結構的冷凍過程是均勻的。如果冷凍速度過快或過慢，或者溫度不穩定，都會導致樣品冷凍不均勻，從而無法獲得高質量的圖像。
3.電鏡參數設置不當:電鏡操作人員需要根據樣品的性質和要求，合理設置電鏡參數，如電壓、放大倍數、對比度等。如果參數設置不當，圖像會模糊或對比度不足。