2001,新疆昌吉衛生學校獲批國家重點中等職業學校。2002年,新疆昌吉衛生學校被評為新疆維吾爾自治區精神文明單位。2003年,教育部對全國重點中等職業學校進行復評,專家組認為新疆昌吉衛生學校在全疆中等職業學校中具有較強的示範作用。2004年,新疆昌吉衛生學校成為教育部確定的65個“國家級護理技能人才示範培訓基地”之壹。2007年,新疆昌吉衛生學校在新疆維吾爾自治區衛生職業學校專業設置評估中取得最好成績。2008年,新疆昌吉衛生學校在新疆維吾爾自治區首批重點中等職業學校人才培養水平評估中獲得第壹名。2008年、2009年,新疆昌吉衛生學校連續兩年獲得新疆維吾爾自治區護理技能大賽壹等獎。2009年8月10,新疆昌吉衛生學校獲得全國職業院校護理技能操作大賽壹等獎,2065年4月38+00,新疆昌吉衛生學校獲得新疆維吾爾自治區職業院校“醫模杯”護理專業技能大賽壹等獎。