中醫學是指以中醫理論和實踐經驗為核心，研究人體生命活動中健康和疾病的轉化規律及其預防、診斷、治療、康復和保健的綜合性科學。中醫以陰陽五行學說為指導，從動態整體的角度研究人體的生理病理藥理及其與自然環境的關系，尋求預防和治療疾病的最有效方法。
任何理論，如果不具備整體概念的特征，就不是完全意義上的中醫。如果它不具有動態性，那麽這個理論就沒有完全把握中醫的真諦。
“整體觀”和“辨證論治”是中醫理論的基本特征，但在現有的中醫中，除了中醫的生理病理系統理論之外，幾乎沒有人能全面做到“整體觀”和“辨證論治”這樣的特征。
既能揭示臟腑陰陽氣化規律、交通關系和天地陰陽氣化規律，又能揭示賣秦證治理論體系。比如中醫從整體觀的角度有“正氣和邪氣是構成疾病的基本矛盾”的概念，這應該是中醫確定疾病名稱的理論依據。
但由於幾乎失去了陰陽五行學說的指導作用和價值，難免混淆了“因”與“證”的區別和聯系，認識到“病”與“證”是疾病的基本要素，卻混淆了“因”與“證”，甚至混淆了不同邏輯範疇的疾病概念。
而陰陽五行屬於中國古代哲學範疇，混淆了哲學和醫學，讓壹些人不服氣，成為質疑其科學性的人的依據。