軌道交通學院現開設城市軌道交通運營管理、城市軌道交通車輛技術、城市軌道交通機電技術、城市軌道交通通信信號技術、高速鐵路工程技術、智能交通技術應用等6個專業,是全國首批骨幹高職院校中央財政支持的重點建設專業群。
其中城市軌道交通運營管理是廣東省壹流職業院校的高水平建設專業和省級重點建設專業。城市軌道交通車輛技術是國家交通高職教育的骨幹專業;智能交通技術應用專業是國家骨幹學校重點專業,廣東省壹流高職院校高水平建設專業,廣東省品牌專業。