全國解放的春風給勞九芝堂帶來了復蘇與振興，1953年成立了私營性質的"新中制藥廠"。1956年公私合營中以勞九芝堂藥鋪為主，合並多家藥店，成立了"九芝堂加工廠"，並設計啟用了"芝"字牌商標，從此，昔日那個芨芨以求於封建生產關系之下的勞九芝堂藥鋪，告別了漫長的風雨飄搖的歷史，跨入了壹個嶄新的時代。1967年更名為長沙市中藥壹廠。1992年在北京人民大會堂的新聞發布會上，正式恢復了老字號廠名為長沙九芝堂制藥廠。
1994年實行公司制改組，組建長沙九芝堂藥業集團公司，實現了工廠制向公司制的轉軌。1995年兼並了國有中型商業企業長沙市藥材公司，有效地實現了工商結合，優勢互補的目標。1996年為加快建立現代企業制度，積極實施集團發展戰略，與長沙神箭制藥總廠實現強強聯合，正式組建了長沙九芝堂（集團）有限公司。1997年10月，與國投興業有限公司結成戰略合作關系，這樣長沙九芝堂（集團）有限公司成為擁有多家全資、控股子公司和參股企業，成為湖南醫藥行業的龍頭。1999年5月，集團公司與國投藥業投資有限公司（現已變更為國投創業投資有限公司）、海南湘遠經濟貿易公司（現已變更為海南湘遠工貿有限公司）、湖南省醫藥公司、湖南長沙友誼（集團）有限公司（現已變更為湖南友誼阿波羅股份有限公司）等五家發起人以發起設立方式成立湖南九芝堂股份有限公司。2000年6月發行社會公眾股4000萬股，並在深圳證券交易所掛牌上市。2002年10月公司實施每10股轉增3股的資本公積金轉增股本方案，轉增後公司總股本變為16720.6萬股，其中社會公眾股5200萬股。2003年8月公司增發5100萬新股，目前公司總股本變為21820.8218萬股，其中社會公眾股10300.2218萬股。
胸懷九州的氣概，期盼芝蘭的美好，與國家發展同步，和時代潮流壹致，這是九芝堂追求的最高境界，這是九芝堂三百年來壹如既往的承諾。今天，歷史把九芝堂帶到了新百年，既帶來了機遇，又迎來了挑戰。經過風吹雨打的九芝堂人，以"欲與天公試比高"之豪氣，以"不管風吹雨打，勝似閑庭信步"的信心，以勇者的姿態，外抓機遇，內促改革，繼續強者腳下延伸的路。"資本多元化、技術創新化、管理科學化、產業規模化、市場國際化"是企業發展的戰略目標，九芝堂將繼續以中成藥為主，努力向生物制藥、西藥等領域拓寬，秉承"九州***濟、芝蘭同芳"的企業理念，發揚三百多年的優良制藥傳統，同時積極采用現代高新技術，力爭2005年躋身中國醫藥業10強和中國企業500強，把壹個嶄新的九芝堂融入公眾心中！