1949年新中國成立，使飽經滄桑的同仁堂獲得了新生。1992年中國北京同仁堂集團公司組建並於2001年改制為國有獨資公司，現代企業制度在同仁堂集團逐步建立完善。
1997年旗下同仁堂股份在上海上交所上市，2000年同仁堂科技在香港聯交所上市,2013年同仁堂國藥在香港聯交所上市，同仁堂集團整體實力躍上了新臺階。
2019年全面落實黨中央關於發展中醫藥事業的決策部署，著眼於“兩個壹百年”奮鬥目標，謀劃同仁堂集團新時代發展的戰略思路，聘請第三方專業公司開展戰略咨詢，開啟了邁向高質量發展的新征程。