商標註冊中的實質審查是決定申請人能否授予商標專用權的關鍵。對商標註冊申請的實質審查從五個方面進行:
(1)商標有法律要件嗎？
我國《商標法》第八條規定了商標的構成要素，即商標應當由文字、圖形、字母、數字、立體標誌和顏色以及上述要素的組合構成。
(2)商標是否違反了禁止條款，即申請註冊的商標是否違反了我國《商標法》第十條、第十壹條、第十二條、第十三條、第十六條規定的禁止條款，以及其他法律法規規定的不能註冊和/或作為商標使用。
(3)審查商標是否符合我國《商標法》第九條的規定:申請註冊的商標應當有顯著特征。
(四)審查該商標是否與他人在先註冊或者初步審定公告的商標相同或者近似；是否侵犯他人合法的在先權利。
(五)審查該商標是否與已過期但未超過壹年的商標相同或者近似。
在對商標註冊申請進行審查的過程中，商標註冊申請人發現商標申請文件有明顯錯誤的，可以申請補正。商標局也可以依法在其職權範圍內予以更正，並通知申請人。該更正不涉及商標註冊申請人的名稱、商標使用的文字、圖形和顏色等商標申請文件的實質性內容。