公司因為自身原因違法違規被列為非正常經營，被工商部門處罰，但公司依然存在。
只要公司沒有註銷，法律主體存在，具有民事權利能力和民事行為能力，能夠依法獨立享有民事權利和承擔民事義務，就可以申請商標註冊。
如果公司註銷了，就不能再申請商標了，因為公司不存在了，法律主體消滅了，那麽民事權利能力和民事行為能力也就終止了。
需要提交的材料:1。申請人以公司名義的，需提供公司營業執照復印件；2 .以個體戶名義提供《個體戶營業執照》復印件和註冊人身份證明；基本信息:1。商標圖案的電子文檔；2.我將免費回答任何關於商標的商品/服務類別和子類別的工商和稅務問題。