目前我國醫保是60%-70%的報銷比例，查乙肝的費用可以報銷，但不同地區、不同醫院的醫保報銷比例存在壹定差異，需要根據當地醫保政策進行分析。
1、對於壹線城市：如果僅查乙肝五項，乙肝表面抗原、乙肝表面抗體、乙肝E抗原和乙肝核心抗體均為陰性，此時只需要查乙肝表面抗體，費用壹般在30-60元，如果查其他項目，如丙肝抗體、艾滋病抗體、梅毒抗體，此時屬於另外的費用，但需要根據當地醫保政策進行報銷；
2、對於二線城市：乙肝表面抗原、乙肝表面抗體、乙肝E抗原和乙肝核心抗體均為陽性時，如果僅查乙肝五項，費用壹般在60-100元，如果查其他項目，如丙肝抗體、艾滋病抗體、梅毒抗體，此時屬於另外的費用，但需要根據當地醫保政策進行報銷；
3、對於三線城市：乙肝表面抗原、乙肝表面抗體、乙肝E抗體和乙肝核心抗體均為陽性時，如果僅查乙肝五項，費用壹般在100-200元，如果查其他項目，如丙肝抗體、艾滋病抗體、梅毒抗體，此時屬於另外的費用，但需要根據當地醫保政策進行報銷；
4、其他原因：如果查肝功能和乙肝病毒DNA，此時屬於另外的費用，因為不同醫院存在不同的收費標準，建議以當地醫院的標準衡量。
對於乙肝患者的治療，除了進行乙肝五項以外，還需要根據患者的肝功能、疾病嚴重程度、年齡、有無肝癌家族史等綜合決定，因此建議及時就診，根據醫生建議選擇治療方案。
乙肝檢查註意事項：
1、乙肝五項包括乙肝表面抗原HBsAg 、乙肝表面抗體HBsAb 、乙肝e抗原HBeAg 、乙肝e抗體HBeAb 、乙肝核心抗體HbcAb。因為核心抗原（HBcag）不易檢出，所以通常只檢查表面抗原抗體，e抗原抗體，因此俗稱為乙肝五項檢測。
2、在進行乙肝五項檢測前當天早上禁食，檢測前天應註意不喝酒、不服用任何藥物。對於正常人來說，每三到五年復查壹次乙肝五項，若沒有抗體的話，要及時接種乙肝疫苗。對於乙肝病毒攜帶者來說，最好每三到六個月查壹次乙肝五項，其他乙肝患者應該在醫生的指導下，按照醫生安排定時進行乙肝五項檢測。
法律依據：
《中華人民***和國社會保險法》
第二十八條
符合基本醫療保險藥品目錄、診療項目、醫療服務設施標準以及急診、搶救的醫療費用，按照國家規定從基本醫療保險基金中支付。
第二十九條
參保人員醫療費用中應當由基本醫療保險基金支付的部分，由社會保險經辦機構與醫療機構、藥品經營單位直接結算。
社會保險行政部門和衛生行政部門應當建立異地就醫醫療費用結算制度，方便參保人員享受基本醫療保險待遇。
第三十條
下列醫療費用不納入基本醫療保險基金支付範圍：
（壹）應當從工傷保險基金中支付的；
（二）應當由第三人負擔的；
（三）應當由公***衛生負擔的；
（四）在境外就醫的。
醫療費用依法應當由第三人負擔，第三人不支付或者無法確定第三人的，由基本醫療保險基金先行支付。基本醫療保險基金先行支付後，有權向第三人追償。