方國珍是浙江黃巖（今浙江黃巖）人，本以販鹽為業。元末農民起義爆發之前，黃巖有人曾發動過壹次反元起義，元軍鎮壓了這支義軍，許多當地百姓因被指為亂黨而無辜被殺。方國珍有壹仇家，勾結官府，誣告方國珍與亂黨是同謀，元軍來捕，方國珍壹怒之下將仇家殺死，與哥哥和弟弟壹起反元。他們聚集了幾千人馬，劫奪海運，捕殺元朝官吏。元朝幾次鎮壓，全被方國珍打敗。後來元以加官晉爵收買方國珍，方國珍與元達成妥協，同時，也註意發展自己的勢力。方國珍既與紅巾軍有聯系，也與元廷有聯系，是兩面派人物。