醫院設有35個臨床、醫技科室。年門診量69萬人次、出院病人5.2萬人次、手術病人2萬人次。神經外科及心血管內科為“省級醫療質量示範科室”；普外科和呼吸內科為“菏澤市醫療質量示範科室”；神經外科為山東省地市級重點專科；普外科作為菏澤市唯壹申報山東省重點專科的專業。