原因特別簡單，太子之所以拉幫結派，那就是對父親的皇位有所覬覦，皇帝當然不希望有人覬覦自己的皇位，即使是自己的親生兒子，即使是自己想要傳位給他的人通通都不可以。並且壹般來說太子拉幫結派，那就是造反的前壹步，只要皇帝發現自己的太子拉幫結派。那麽大多都會廢太子。
比如說我們熟知的康熙和他的太子允礽，要說起來康熙對自己的這個兒子真的特別好，因為允礽的生母赫舍裏皇後是康熙的原配。也是康熙這壹生最為摯愛的女子。為了給康熙生下嫡子，赫舍裏皇後難產而死，所以對於這個孩子康熙格外的看重，從允礽壹小就帶著自己的身邊親子教育撫養。古人都說慈母多敗兒，其實慈父也多敗兒，正是因為康熙對這個允礽特別好，所以在中後期允礽竟然開始拉幫結派，準備和索額圖壹起謀大事。
康熙晚年遭遇九子奪嫡，但實際上這並不是讓康熙最為傷心的，他最為傷心的是這個自己壹手帶大的兒子竟然企圖造反，覬覦自己的皇位。允礽和朝中大臣來往密切，尤其是和索額圖，康熙都看在眼裏，在兩次廢黜允礽的太子之位後，允礽最終無緣皇位。
即使不是太子，是普通的皇子拉幫結派皇帝也是不能容忍的。雍正創立了秘密立儲制度，而雍正的皇子弘時也經常和朝中大臣壹起拉幫結派，覬覦雍正的皇位，並且他拉幫結派的大臣還曾經是雍正的政敵，雍正當然很生氣，於是先把他過繼給了八爺，後來又直接把他削除了宗籍，直接不認他這個兒子。所以我們也不能看出皇帝對於自己的兒子拉幫結派，企圖覬覦自己的皇位這種事情真的是零容忍，壹旦發現絕不姑息。