瑪雅人最崇拜的神，有天神、地神、玉米神、雨神和戰神。這些神，都主宰著人的農事和現世的幸福。天神“伊察姆納”，是瑪雅人崇拜的最高神，也是祭司的保護神，他創造了瑪雅的文字和科學知識，地力之神“伊什切爾”是他的妻子。土地是瑪雅人的命根子，所以他們非常崇拜土地的保護神“恰克”。東、西、南、北，都有恰克神，方位不同的恰克，顏色也不同。東方的恰克神是紅色的，西方的恰克神是黑色的，南方的恰克神是黃色的，而北方的恰克神則是白色的。
玉米神玉米神是農人最崇拜的神，他是壹位身強力壯的年輕人形象的“尤姆卡什”；死神“阿赫·普契”，則是壹具令人恐懼的骷髏；戰神“卡庫帕卡特”，是軍事貴族們的保護神。瑪雅人的商業非常發達，還有很多的可可種植場，他們都崇拜商人的保護神“埃克楚亞赫”。
瑪雅人認為，有四位天神“霍布尼爾”、“坎齊克那”、“薩克基米”和“霍桑埃克”，他們每年壹輪(後來變成20年壹輪)地統治著世界。整個宇宙有十三重天和九重地，在東、西、南、北四個方位，各有壹棵“宇宙樹”，圍繞著宇宙世界中央的壹棵綠樹。每棵“宇宙樹”上，都住著壹位恰克神，每位恰克神都有壹個大水罐，當他們傾斜水罐倒水的時候，便形成雨。宇宙中央大樹的綠蔭下，有壹座美輪美奐的天堂，天堂裏住著壹位天堂之神“伊什塔布”。和天堂遙遙相對的地方，有壹座地獄，人死以後上升進天堂，還是墜下地獄，取決於他壹生中所做所為，也取決於他生前的社會地位和死亡的方式。他們認為，整個世界要經歷幾個時代，當人們的道德標準低下、人靈魂變壞的時候，這個時代就要結束。
商旅的保護神——北極星神。瑪雅人有壹個專職的宗教祭司集團，他們主要負責節日禮儀，施行聖禮、占蔔和預言。他們日常裏誦讀經書，對貴族們進行勸告，並回答解釋壹些貴族們提出的問題。他們還培訓壹些小祭司，教他們領悟各種學問和禮儀，規定他們的職責，並教育他們如何去做人的楷模，然後送他們去壹些小城鎮去主持祭祀。他們還把自己的兒子和貴族的次子，從小便加以培養，教他們歷法推算、醫學、閱讀經書，使他們成為祭司集團的繼承人。高級祭司稱“阿金邁”或“奧坎邁”，他們極為富有(接受貴族和城鎮居民的貢納和祭品)，受人尊敬(只有他們才能與神靈溝通，並為人向神靈祈禱)。
祭司蠟像“契蘭”是專門負責把神對人的答復告訴人的祭司，他們備受尊敬，人們常把他們擡在肩上。“恰克”有四位，他們專門負責協助祭司完成祭祀儀式。“科納姆”是官員，有兩名，壹名專門作剖開用來祭奠的活人胸膛的；另壹名要從軍事首領或立有戰功的人中選出。他們任期三年，享有很高的榮譽。瑪雅人還有醫師和巫師，他們主要給病人疼痛的地方放血治病。瑪雅時期的宗教很興盛，頂端建有廟宇的金字塔，星羅棋布。這些金字塔，都是瑪雅人舉行宗教活動的儀禮中心。瑪雅的許多大城市，都是當時的宗教城市，如危地馬拉的基禮瓜城，尤卡坦半島南端的科潘。當時有很多與宗教相關的工匠藝人，如雕刻各種石像、木像和焙制陶器的，為廟宇描繪壁畫、天頂的，以及縫制祭服的裁縫等。瑪雅人建有公***的廟宇，是人們進行宗教活動的場所。貴族和富人們都在家裏設有禱告室，供有神像，常供著祭品，並進行祈禱。被崇拜的偶像，有石頭的、木頭做的，也有泥制的，以木雕的最為珍貴，往往都被作為傳家之寶。瑪雅人也崇拜契琴伊察的泉水，他們去那裏奉獻祭品，進行朝拜。在朝拜的路上，要是遇到了被廢棄的廟宇，也要進去燃燒樹脂，祭祀禱告。
商旅的保護神———北極星神。