（1）物理滅鼠：物理滅鼠主要是利用物理學的原理（力學平衡原理和杠桿作用）制成捕鼠器械滅鼠。物理滅鼠的歷史較久，應用的方式較多。也叫物理學滅鼠方法。主要是利用各種器械對老鼠進行捕殺。其優點是對人、畜安全，尤其是對大的家畜，壹般不會造成傷害，對環境無殘留毒害，鼠屍易清除，滅鼠效果明顯。適於小面積滅鼠，對家庭捕殺和野外遷入室內的少數鼠類或大面積滅鼠後的殘留鼠將起到壹定的控制作用，是目前室內廣泛采用的滅鼠方法。缺點是費工、成本高、投資大。現有的器械約有百余種，包括壓、卡、關、夾、翻、灌、挖、粘和槍擊等。主要有夾類、籠類、套扣類、壓板類、刺殺類，以及水淹法、扣捕法、電子捕鼠器法等。物理滅鼠也講究科學技術，如安放鼠籠（夾）要放在鼠洞口，應與鼠洞有壹定距離，有時用些偽裝，可以提高捕殺率；鼠籠上的誘餌要新鮮，應是鼠類愛吃的食物。壹般第壹個晚上鼠類不易上籠，因有“新物反應”，2～3天後上籠率會提高。
（2）化學滅鼠：化學滅鼠是指使用有毒化合物殺滅鼠類的方法，又稱藥物滅鼠法或毒餌滅鼠法，是目前國內外滅鼠最為廣泛應用的方法。從未來滅鼠的發展趨勢看，無論城市、農村，還是鼠類嚴重的農田，化學滅鼠仍是鼠害綜合治理的主要手段之壹。它突出的優點是滅效高、見效快，無論在害鼠大量發生為害以前，還是已經大量發生為害，化學藥物滅鼠都可及時收到顯著的防治效果。化學滅鼠包括胃毒劑、熏殺劑、驅避劑和絕育劑等。化學滅鼠的優點是方法簡單、工效高、滅效好、見效快、經濟。缺點是易汙染環境，如果滅鼠藥使用不慎或保管不當，易引起人、畜中毒。
化學滅鼠使用的化學藥物品種主要有抗凝血慢性殺鼠劑和急性殺鼠劑兩大類。第壹代抗凝血慢性殺鼠劑品種主要有敵鼠鈉鹽、殺鼠靈、殺鼠迷、特殺鼠2號等，第二代有溴敵隆、大隆、殺它仗等，這類藥劑對人、畜比較安全，也有特效解毒藥品，要避免家禽、家畜誤食。抗凝血慢性殺鼠劑滅鼠效果好，尤其是大面積應用十分顯著。急性殺鼠劑常用的有磷化鋅、毒鼠磷（限制使用）、滅鼠安等，在使用時要切實註意安全，嚴密組織，以防中毒，限制應用於野外，室內不宜使用。滅鼠前需將殺鼠劑配制成新鮮的毒餌或成型的毒餌後對老鼠進行滅殺。化學滅鼠應嚴禁使用氟乙酰胺（1081）、氟乙酸鈉（1080）、毒鼠強（424）、毒鼠矽和甘氟等國家禁止使用的危險性殺鼠劑進行滅鼠，確保人畜安全。
（3）生物防治：是指利用鼠類的天敵捕食鼠類或利用有致病力的病原微生物消滅鼠類以及利用外激素控制鼠類數量上升的方法。主要包括兩個方面：壹是利用天敵滅鼠，鼠類的天敵很多，主要是食肉目的小獸：如黃鼬、野貓、家貓、狐等和鳥類中的猛禽，如鷹、貓頭鷹等和蛇類。二是利用對人、畜無毒而對鼠有致病力的病原微生物滅鼠，這種方法要求條件很嚴，進展很慢。控制鼠類的微生物主要指壹些能使鼠類致病的致病病原生物，如肉毒梭菌就是其中的壹種。三是采用引入不同遺傳基因或用物理、化學的誘變因素改變鼠類種群基因庫，使之因不適應環境或喪失種群調節作用而達到防治目的。
（4）生態控制：生態控制又稱生態學滅鼠法，主要包括環境改造，斷絕鼠糧，防鼠建築，消除鼠類隱蔽場所等。改變、破壞害鼠生活的環境條件並不能直接或立即殺滅鼠類，但對鼠類生活不利，可減少鼠類的增殖或增加其死亡率，從而降低害鼠的密度。改變生態環境，造成不利於害鼠生存和繁殖的條件，以降低害鼠密度，是生態防治的重要手段。生態滅鼠涉及面廣，也是壹種綜合性措施，雖然只著眼於防而不能直接殺滅鼠類，收效較慢，但與其他方法配合進行，就會提高其滅鼠效果，而且可使其防治效果持久，收到事半功倍的效果。生態學滅鼠是鼠害綜合防治中很重要的壹環。